Preview

Ученые записки Санкт-Петербургского государственного медицинского университета имени академика И. П. Павлова

Расширенный поиск

InDel-ПОЛИМОРФИЗМ В КОЛИЧЕСТВЕННОЙ ОЦЕНКЕ ПОСТТРАНСПЛАНТАЦИОННОГО ХИМЕРИЗМА

https://doi.org/10.24884/1607-4181-2016-23-4-40-45

Полный текст:

Аннотация

Ключевыми критериями эффективности аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток (алло-ТГСК) являются снижение уровня минимальной остаточной болезни до неопределяемых значений и приживление трансплантируемых клеток с полным замещением гемопоэза реципиента – так называемым посттрансплантационным химеризмом. Среди многообразия применяемых методик определенными преимуществами обладают молекулярногенетические методы исследований, базирующиеся на анализе высокополиморфных участков ДНК – коротких тандемных повторов (short tandem repeats, STR). Однако данный подход, несмотря на высокую информативность, обладает ограниченной чувствительностью. В этой связи представляется целесообразным внедрение более чувствительных диагностических решений, в частности, анализа InDelполиморфизма, с последующим выявлением продуктов ПЦР в режиме реального времени. При анализе ряда маркеров были получены данные, свидетельствующие о более высокой чувствительности данного метода, однако наличие отклонений в оценке соотношений клеток в интервале от 10 до 90 % указывает на целесообразность использования данного подхода лишь при оценке остаточной популяции клеток реципиента.

Об авторах

И. М. Бархатов
Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И. П. Павлова
Россия
заведующий лабораторией трансплантологии и молекулярной гематологии НИИ ДОГиТ им. Р.М.Горбачевой


А. И. Шакирова
Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И. П. Павлова
Россия
биолог лаборатории трансплантологии и молекулярной гематологии НИИ ДОГиТ им. Р.М.Горбачевой


А. В. Евдокимов
Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И. П. Павлова
Россия
врач клд лаборатории трансплантологии и молекулярной гематологии НИИ ДОГиТ им. Р.М.Горбачевой


О. Г. Смыкова
Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И. П. Павлова
Россия
врач-интерн


Д. Е. Ершов
Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И. П. Павлова
Россия
врач клд лаборатории трансплантологии и молекулярной гематологии НИИ ДОГиТ им. Р.М.Горбачевой


Л. С. Зубаровская
Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И. П. Павлова
Россия
проф. кафедры гематологии, трансфузиологии и траснплантологии ФГБОУ ВО ПСПбГМУ им. И.П. Павлова Минздрава России


Б. В. Афанасьев
Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И. П. Павлова
директор НИИ ДОГиТ им. Р.М.Горбачевой


Список литературы

1. Alizadeh M., Bernard M., Danic B. et al. Quantitative assessment of hematopoietic chimerism after bone marrow transplantation by real-time quantitative polymerase chain reaction // Blood. – 2002. – Vol. 99. – № 12. – P. 4618–4625.

2. Allor C., Einum D. D., Scarpetta M. Identification and characterization of variant alleles at CODIS STR loci// J. Forensic Sci. – 2005. – Vol. 50. – № 5. – P. 1128–1133.

3. Alpar D., Nagy G., Hohoff C. et al. Sex chromosome changes after sex-mismatched allogeneic bone marrow transplantation can mislead the chimerism analysis // Pediatr. Blood Cancer. – 2010. – Vol. 55. – № 6. – P. 1239–1242.

4. Bolan C. D., Leitman S. F., Griffith L. M. et al. Delayed donor red cell chimerism and pure red cell aplasia following major ABO-incompatible nonmyeloablative hematopoietic stem cell transplantation // Blood. – 2001. – Vol. 98 – № 6. – P. 1687–1694.

5. Choe W., Hwang M. A., Jang S. et al.Establishing a populationbased HLA-antibody panel for flow cytometric monitoring of chimerism in HLAhaploidentical stem cell transplantation // Ann. Clin. Lab. Sci. – 2016. – Vol. 46. – № 2. - P. 161–167.

6. Ensenberger M. G., Hill C. R., McLaren R. S. et al. Developmental validation of the PowerPlex?? 21 System // Forensic Sci. Int. Genet. – 2014. – Vol. 9. – № 1. – P. 169–178.

7. Fehse B., Chukhlovin A., Kuhlcke K. et al. Real-time quantitative Y chromosome-specific PCR (QYCS-PCR) for monitoring hematopoietic chimerism after sex-mismatched allogeneic stem cell transplantation// J. Hematother. Stem Cell Res. – 2001. – Vol. 10. – № 3. – P. 419–425.

8. Krenke B. E., Tereba A., Anderson S. J. et al. Validation of a 16locus fluorescent multiplex system// J. Forensic Sci. – 2002. – Vol. 47. – № 4. – P. 773–785.

9. Kristt D. Assessing quantitative chimerism longitudinally: technical considerations, clinical applications and routine feasibility/ D. Kristt, J. Stein, I. Yaniv, T. Klein // Bone Marrow Transplant. – 2007. – Vol. 39. – № 5. – P. 255–268.

10. Lion T., Watzinger F., Preuner S. et al. The EuroChimerism concept for a standardized approach to chimerism analysis after allogeneic stem cell transplantation // Leukemia. – 2012. – Vol. 26. – № 8. – P. 1821–1828.

11. Nollet F.Standardisation of multiplex fluorescent short tandem repeat analysis for chimerism testing. / F. Nollet, J. Billiet, D. Selleslag, A. Criel // Bone Marrow Transplant. – 2001. – Vol. 28. – № 5. – P. 511–518.

12. Schumm M., Feuchtinger T., Pfeiffer M. Flow cytometry with anti HLAantibodies: a simple but highly sensitive method for monitoring chimerism and minimal residual disease after HLA-mismatched stem cell transplantation// Bone Marrow Transplant. – 2007. – Vol. 39. – № 12. – P. 767–773.


Дополнительные файлы

1. Рисунок 1.
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (467KB)    
Метаданные
2. Исправленный вариант статьи
Тема
Тип Прочее
Скачать (1MB)    
Метаданные

Для цитирования:


Бархатов И.М., Шакирова А.И., Евдокимов А.В., Смыкова О.Г., Ершов Д.Е., Зубаровская Л.С., Афанасьев Б.В. InDel-ПОЛИМОРФИЗМ В КОЛИЧЕСТВЕННОЙ ОЦЕНКЕ ПОСТТРАНСПЛАНТАЦИОННОГО ХИМЕРИЗМА. Ученые записки Санкт-Петербургского государственного медицинского университета имени академика И. П. Павлова. 2016;23(4):40-45. https://doi.org/10.24884/1607-4181-2016-23-4-40-45

For citation:


Barkhatov I.M., Shakirova A.I., Evdokimov A.V., Ershov D.E., Smykova O.G., Zubarovskaya L.S., Afanasyev B.V. InDel polymorphisms in quantitative posttransplant chi merism evaluation. The Scientific Notes of the Pavlov University. 2016;23(4):40-45. (In Russ.) https://doi.org/10.24884/1607-4181-2016-23-4-40-45

Просмотров: 227


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 1607-4181 (Print)
ISSN 2541-8807 (Online)