uzspbgmuУчёные записки Первого Санкт-Петербургского государственного медицинского университета имени академика И. П. ПавловаThe Scientific Notes of the Pavlov University1607-41812541-8807Academician I.P. Pavlov First St. Petersburg State Medical University10.24884/1607-4181-2016-23-4-40-45uzspbgmu-352Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ РАБОТЫORIGINAL PAPERSInDel-ПОЛИМОРФИЗМ В КОЛИЧЕСТВЕННОЙ ОЦЕНКЕ ПОСТТРАНСПЛАНТАЦИОННОГО ХИМЕРИЗМАInDel polymorphisms in quantitative posttransplant chi merism evaluationБархатовИ. М.BarkhatovI. M.

заведующий лабораторией трансплантологии и молекулярной гематологии НИИ ДОГиТ им. Р.М.Горбачевой

i.barkhatov@gmail.comШакироваА. И.ShakirovaA. I.

биолог лаборатории трансплантологии и молекулярной гематологии НИИ ДОГиТ им. Р.М.Горбачевой

lilyup@yandex.ruЕвдокимовА. В.EvdokimovA. V.

врач клд лаборатории трансплантологии и молекулярной гематологии НИИ ДОГиТ им. Р.М.Горбачевой

leshechka10.09.84@yandex.ruСмыковаО. Г.ErshovD. E.

врач-интерн

olesya.gen@gmail.comЕршовД. Е.SmykovaO. G.

врач клд лаборатории трансплантологии и молекулярной гематологии НИИ ДОГиТ им. Р.М.Горбачевой

daniil.e.ershov@gmail.comЗубаровскаяЛ. С.ZubarovskayaL. S.

проф. кафедры гематологии, трансфузиологии и траснплантологии ФГБОУ ВО ПСПбГМУ им. И.П. Павлова Минздрава России

zubarovskaya_ls@mail.ruАфанасьевБ. В.AfanasyevB. V.

директор НИИ ДОГиТ им. Р.М.Горбачевой

bvafan@gmail.comПервый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И. П. ПавловаRussian Federation2016301220162344045Copyright © Бархатов И.М., Шакирова А.И., Евдокимов А.В., Смыкова О.Г., Ершов Д.Е., Зубаровская Л.С., Афанасьев Б.В., 20162016Бархатов И.М., Шакирова А.И., Евдокимов А.В., Смыкова О.Г., Ершов Д.Е., Зубаровская Л.С., Афанасьев Б.В.Barkhatov I.M., Shakirova A.I., Evdokimov A.V., Ershov D.E., Smykova O.G., Zubarovskaya L.S., Afanasyev B.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.sci-notes.ru/jour/article/view/352

Ключевыми критериями эффективности аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток (алло-ТГСК) являются снижение уровня минимальной остаточной болезни до неопределяемых значений и приживление трансплантируемых клеток с полным замещением гемопоэза реципиента – так называемым посттрансплантационным химеризмом. Среди многообразия применяемых методик определенными преимуществами обладают молекулярногенетические методы исследований, базирующиеся на анализе высокополиморфных участков ДНК – коротких тандемных повторов (short tandem repeats, STR). Однако данный подход, несмотря на высокую информативность, обладает ограниченной чувствительностью. В этой связи представляется целесообразным внедрение более чувствительных диагностических решений, в частности, анализа InDelполиморфизма, с последующим выявлением продуктов ПЦР в режиме реального времени. При анализе ряда маркеров были получены данные, свидетельствующие о более высокой чувствительности данного метода, однако наличие отклонений в оценке соотношений клеток в интервале от 10 до 90 % указывает на целесообразность использования данного подхода лишь при оценке остаточной популяции клеток реципиента.

Reduction of minimal residual disease to undetectable levels is the key criterion for efficiency of allogeneic hematopoietic stem cell transplantation (alloHSCT), along with engraftment of transplanted cells with complete replacement of recipient hematopoiesis, i. e., full posttransplant chimerism. Among different approaches, molecular genetic techniques are preferable, being based on the analysis of highly polymorphic DNA sequences (short tandem repeats, STRs). However, this approach, despite its high specificity, has a limited sensitivity. In this regard, it seems appropriate to introduce more sensitive diagnostic solutions, in particular, analysis of insertion/deletion (InDel) polymorphisms, followed by real-time detection of PCR products. The data obtained upon analysis of several genetic markers have shown higher sensitivity of this method. However, the deviations in the range of 10 to 90 % in evaluation of the cell ratios indicates the feasibility of using this approach just to evaluate the residual populations of recipient cells.

химеризмаллогенная трансплантация гемопоэтических стволовых клетокмикросателитные повторыInDel полиморфизмыSTRлокусыchimerismallogeneic hematopoietic stem cell transplantationINDEL polymorphismsSTR markersРоссийский Фонд Фундаментальных Исследований (проект №16-54-00198)ReferencesAlizadeh M., Bernard M., Danic B. et al. Quantitative assessment of hematopoietic chimerism after bone marrow transplantation by real-time quantitative polymerase chain reaction // Blood. – 2002. – Vol. 99. – № 12. – P. 4618–4625.Alizadeh M., Bernard M., Danic B. et al. Quantitative assessment of hematopoietic chimerism after bone marrow transplantation by real-time quantitative polymerase chain reaction // Blood. – 2002. – Vol. 99. – № 12. – P. 4618–4625.Allor C., Einum D. D., Scarpetta M. Identification and characterization of variant alleles at CODIS STR loci// J. Forensic Sci. – 2005. – Vol. 50. – № 5. – P. 1128–1133.Allor C., Einum D. D., Scarpetta M. Identification and characterization of variant alleles at CODIS STR loci// J. Forensic Sci. – 2005. – Vol. 50. – № 5. – P. 1128–1133.Alpar D., Nagy G., Hohoff C. et al. Sex chromosome changes after sex-mismatched allogeneic bone marrow transplantation can mislead the chimerism analysis // Pediatr. Blood Cancer. – 2010. – Vol. 55. – № 6. – P. 1239–1242.Alpar D., Nagy G., Hohoff C. et al. Sex chromosome changes after sex-mismatched allogeneic bone marrow transplantation can mislead the chimerism analysis // Pediatr. Blood Cancer. – 2010. – Vol. 55. – № 6. – P. 1239–1242.Bolan C. D., Leitman S. F., Griffith L. M. et al. Delayed donor red cell chimerism and pure red cell aplasia following major ABO-incompatible nonmyeloablative hematopoietic stem cell transplantation // Blood. – 2001. – Vol. 98 – № 6. – P. 1687–1694.Bolan C. D., Leitman S. F., Griffith L. M. et al. Delayed donor red cell chimerism and pure red cell aplasia following major ABO-incompatible nonmyeloablative hematopoietic stem cell transplantation // Blood. – 2001. – Vol. 98 – № 6. – P. 1687–1694.Choe W., Hwang M. A., Jang S. et al.Establishing a populationbased HLA-antibody panel for flow cytometric monitoring of chimerism in HLAhaploidentical stem cell transplantation // Ann. Clin. Lab. Sci. – 2016. – Vol. 46. – № 2. - P. 161–167.Choe W., Hwang M. A., Jang S. et al.Establishing a populationbased HLA-antibody panel for flow cytometric monitoring of chimerism in HLAhaploidentical stem cell transplantation // Ann. Clin. Lab. Sci. – 2016. – Vol. 46. – № 2. - P. 161–167.Ensenberger M. G., Hill C. R., McLaren R. S. et al. Developmental validation of the PowerPlex?? 21 System // Forensic Sci. Int. Genet. – 2014. – Vol. 9. – № 1. – P. 169–178.Ensenberger M. G., Hill C. R., McLaren R. S. et al. Developmental validation of the PowerPlex?? 21 System // Forensic Sci. Int. Genet. – 2014. – Vol. 9. – № 1. – P. 169–178.Fehse B., Chukhlovin A., Kuhlcke K. et al. Real-time quantitative Y chromosome-specific PCR (QYCS-PCR) for monitoring hematopoietic chimerism after sex-mismatched allogeneic stem cell transplantation// J. Hematother. Stem Cell Res. – 2001. – Vol. 10. – № 3. – P. 419–425.Fehse B., Chukhlovin A., Kuhlcke K. et al. Real-time quantitative Y chromosome-specific PCR (QYCS-PCR) for monitoring hematopoietic chimerism after sex-mismatched allogeneic stem cell transplantation// J. Hematother. Stem Cell Res. – 2001. – Vol. 10. – № 3. – P. 419–425.Krenke B. E., Tereba A., Anderson S. J. et al. Validation of a 16locus fluorescent multiplex system// J. Forensic Sci. – 2002. – Vol. 47. – № 4. – P. 773–785.Krenke B. E., Tereba A., Anderson S. J. et al. Validation of a 16locus fluorescent multiplex system// J. Forensic Sci. – 2002. – Vol. 47. – № 4. – P. 773–785.Kristt D. Assessing quantitative chimerism longitudinally: technical considerations, clinical applications and routine feasibility/ D. Kristt, J. Stein, I. Yaniv, T. Klein // Bone Marrow Transplant. – 2007. – Vol. 39. – № 5. – P. 255–268.Kristt D. Assessing quantitative chimerism longitudinally: technical considerations, clinical applications and routine feasibility/ D. Kristt, J. Stein, I. Yaniv, T. Klein // Bone Marrow Transplant. – 2007. – Vol. 39. – № 5. – P. 255–268.Lion T., Watzinger F., Preuner S. et al. The EuroChimerism concept for a standardized approach to chimerism analysis after allogeneic stem cell transplantation // Leukemia. – 2012. – Vol. 26. – № 8. – P. 1821–1828.Lion T., Watzinger F., Preuner S. et al. The EuroChimerism concept for a standardized approach to chimerism analysis after allogeneic stem cell transplantation // Leukemia. – 2012. – Vol. 26. – № 8. – P. 1821–1828.Nollet F.Standardisation of multiplex fluorescent short tandem repeat analysis for chimerism testing. / F. Nollet, J. Billiet, D. Selleslag, A. Criel // Bone Marrow Transplant. – 2001. – Vol. 28. – № 5. – P. 511–518.Nollet F.Standardisation of multiplex fluorescent short tandem repeat analysis for chimerism testing. / F. Nollet, J. Billiet, D. Selleslag, A. Criel // Bone Marrow Transplant. – 2001. – Vol. 28. – № 5. – P. 511–518.Schumm M., Feuchtinger T., Pfeiffer M. Flow cytometry with anti HLAantibodies: a simple but highly sensitive method for monitoring chimerism and minimal residual disease after HLA-mismatched stem cell transplantation// Bone Marrow Transplant. – 2007. – Vol. 39. – № 12. – P. 767–773.Schumm M., Feuchtinger T., Pfeiffer M. Flow cytometry with anti HLAantibodies: a simple but highly sensitive method for monitoring chimerism and minimal residual disease after HLA-mismatched stem cell transplantation// Bone Marrow Transplant. – 2007. – Vol. 39. – № 12. – P. 767–773.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.